据说早年间段祺瑞生活拮据，跟自己的政敌黎元洪借过7万元，一直无力偿还，还被黎元洪告上法庭。等到段祺瑞自临时执政的位置上退下来，就没有了经济来源，一大家子人过得更加艰难，时而还得靠段祺瑞的亲信资助度日。1928年，蒋介石得知段家生活确实困难，于是“送上2万元，在此后三四年间，又送过数万元，生活问题遂得到解决”，可想而知段祺瑞一大家子人过的是什么日子。1928年5月，段祺瑞又联络徐世昌、王士珍、曹锟、熊希龄等北洋元老呼吁南北双方停止战争，发起了“和平运动”。10月1日，外间传出安福系在天津、大连一带大肆活动，段祺瑞为避嫌到大连休养，于翌年才回到天津。
1930年2月，冯玉祥和阎锡山联合反蒋，中原大战爆发。日本人密谋借机策动“北洋派大同盟”，拥段祺瑞和吴佩孚为领袖，建立华北的傀儡政权，从而控制华北地区。日本特务头子土肥原贤二积极推动该项计划，并在天津安排段祺瑞和溥仪见过一次面，不过此次会晤让双方都甚不愉快，事后段祺瑞就恼怒地说：“鄙人不才，忝为国家元首，这小子到今天还摆皇帝的臭架子，真是岂有此理。”加上吴佩孚也不买账，日本人的如意算盘就此落空。