为镇守边疆，明朝对西南实行了土流并治等政策，设立五开卫以防暴乱、进攻。此时受战乱、时事的影响举家搬迁的百姓择地而居，官僚政府对落户民众予以减税免税政策，鼓励移民常住。黔东南、黔南正是其他民族集中居住的地区，苗民对于新来的邻居很热情，帮助汉民修建房屋，汉苗两族得以以较为和平的方式融合。
这种欣欣向荣的民族大团结局面真正打破了中国各民族之间的隔阂和仇视的界限。中原和西南地区（黔、云还有周边诸省，远达越南等）的沟通也随之加强，茶叶贸易成为明初开始兴盛的一个收益极高的产业，满足了其他民族对内地手工产品和粮食之需。在这一时期，西南接受了一批纺织手工业主的投资和产业转移，出现了一些大宗交易市场（今日的黔东南苗族侗族自治州还保留着的镇远古镇正是其中的代表），具备了一定的自给自足能力。
2.北直隶：移民内迁
在华北京原上，隶属于明北直隶的百姓也同样面临着移民的选择，只不过略有不同的是，这种迁移并非从中原向蛮荒，而是从京城附近抽调向京城方向转移。为何南北之间存在这么大的差异？元末明初，太祖朱元璋与陈友谅、张士诚决战之后，自南（南京）向北一路北上直灭元大都，将元朝的傀儡政权驱逐到大明北部的草原。然而，草原粮食稀缺，生活用品不足，习惯了奢华生活的北元贵族不得不化身骑兵匪徒南下掠夺，给大明北方的百姓带来深重的灾难。此外，明初四大案自上而下牵连无数，朱棣自封地“靖难”，从北京南下达到南京，在北直隶地区发生了几场大的战役，夺位一路刀光剑影，附近百姓无不受其害。此外，封建帝制时期农业生产饱受自然灾害的影响，其中蝗灾常光顾秦岭淮河略靠北一带，北方又多发旱灾，而地震、瘟疫等对于百姓生活而言更是难以提防。为了应对可能袭来的天灾人祸，必须建立起以大城市、市镇为中心的城乡体系，通过中央集权的力量庇护一方百姓。