武则天临朝称制后，武承嗣认为“武氏当有天下”。于是，他积极地为提高武氏声威出谋献策，为武则天称帝大造舆论。武承嗣建议武则天“追王其祖，立武氏七庙”。武承嗣让人在一块白石上，凿了“圣母临人，永昌帝业”8个字，并以“紫石杂药”装饰起来，然后令雍州人唐同泰献给太后。武则天高兴地称之为“天授圣图”。在武承嗣等大搞君权神授迷信活动的喧闹声中，九月，武则天改唐为周，自己做起“对神皇帝”。武则天称帝后，武承嗣被封为魏王，食封千户，监修国史。
武承嗣还极力向武则天建议“去唐家子孙，诛大臣不附者”。徐敬业、骆宾王等为反对武则天掌权，在扬州起兵。武承嗣屡劝武则天诛杀他们。后来武承嗣唆使酷吏周兴罗织唐高宗李治子隋州刺史泽王李上金、舒州刺史许王李素节谋反罪名。在押解途中，派人缢杀李素节、李上金，并杀光他们同党。接着又杀南安王李颖等李姓宗室12人。与此同时，武承嗣还劝武则天杀掉李孝逸、韦方质等许多声望甚高，但不曲事武氏的文武大臣，大杀李唐宗室和不附己的文武大臣，无疑为武则天称帝扫清了道路。