按说这样的安排需要维持下去的，不过眼界不一样的郑勋睿，很快发现其中的问题，那就是这样的安排，无形之中排斥了人才，让其他愿意依附之人望而却步。
既然你郑勋睿只愿意用自身的心腹，那么其他人看在眼里，记在心里，不愿意投奔你，人家到你这里来了，也得不到重用，也没有施展才华的机会，郑勋睿如此的安排，自己倒是放心了，可随着时间的推移，他将遭受到更大的损失，而且这样的损失是慢慢体现出来的，真的到了无法挽回的那一天，一切都晚了。
或许大规模的调整，会让郑勋睿担心一段时间，担心六部和都察院出现这样那样的问题，但只要经过一段时间的磨合，这种吸纳各方人才的做法，就会彰显出来巨大的力量，促使各地更快的发展。
凡事有利有弊，只要有利的地方远远大于不利的地方，那就毫不犹豫的贯彻落实，特别是在大政方针，更是要有快刀斩乱麻的决心和方式。
经过了几天时间的思考，郑勋睿终于下定了决心，而且是独自下定决心，没有同任何人商议，领袖的目光和下面之人总是不一样，看的更加深远一些。
崇祯十六年二月初一，郑勋睿以南京兵部尚书的名义，在兵部召集了诸多的官吏，宣布他对南京六部、都察院、大理寺、国子监以及锦衣卫、南京京营等的调整方案。